Sequence analysis of wheat subtelomeres

Un equipo del Instituto de Agricultura Sostenible-CSIC liderado por la Dra. Pilar Prieto (@PilarPrietoAra1) con colaboración del investigador Dr. Miguel Aguilar de la Universidad de Córdoba publican un trabajo sobre “Análisis de la secuencia de los subtelomeros de trigo”

Aguilar M, Prieto P.2020. Sequence analysis of wheat subtelomeres reveals a high polymorphism among homoeologous chromosomes. Plant Genome. 2020;e20065. https://doi.org/10.1002/tpg2.20065

Resumen: En este trabajo Aguilar & Prieto presentan un análisis molecular detallado de las regiones subteloméricas de los cromosomas de trigo. Los autores han observado un elevado polimorfismo en los subtelómeros de los cromosomas homeólogos (cromosomas equivalentes de cada subgenoma del trigo) para todas las características estudiadas: genes, elementos transponibles, repeticiones, contenido en GC, predicción de islas CpG, puntos calientes de recombinación y motivos de secuencias diana para proteínas relevantes de unión a ADN. El elevado polimorfismo encontrado en estas regiones subteloméricas puede ser la base molecular de la especificidad que existe entre cromosomas homólogos (cromosomas equivalentes en el mismo subgenoma de trigo) durante las interacciones iniciales (reconocimiento y asociación) al inicio de la meiosis en trigo.

Summary: Aguilar & Prieto report a detailed molecular analysis of wheat subtelomeres and showed a high polymorphism in the subtelomeric region among homoeologues (equivalent chromosomes from related genomes) for all the features analyzed, including genes, transposable elements, repeats, GC content, predicted CpG islands, recombination hotspots and targeted sequence motifs for relevant DNA-binding proteins. These polymorphisms might be the molecular basis for the specificity of homologous recognition and pairing in initial chromosome interactions at the beginning of meiosis in wheat.

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